Genómica Funcional y Ciencia de Datos

JEFE DE LABORATORIO

El Dr. Mario Rossi es biólogo graduado en la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires (1998) y Doctor en Biología Molecular y Celular por la Universidad de Roma “Tor Vergata” (2003).

Es Investigador Independiente de la Carrera del Investigador Científico y Tecnológico del CONICET. Realizó estudios posdoctorales en la Unidad de Toxicología del Medical Research Council (Leicester, UK), en el Instituto Tecnológico de Israel (Technion, Haifa) y en el NYU Langone Medical Center (NYC, USA).

ACERCA DEL LABORATORIO

El Laboratorio de Genómica Funcional y Ciencia de Datos cuenta con una sólida y bien documentada experiencia en investigación y desarrollo en el campo de la oncología molecular y modelos animales. El laboratorio tiene un enfoque transdisciplinar, y sus investigaciones implican una estrecha colaboración con distintos grupos de investigación a nivel nacional e internacional.

Hemos desarrollado ensayos genéticos a gran escala que permitieron la identificación de distintos componentes del sistema ubiquitina-proteasoma (UPS) con nuevas funciones en la regulación de la proliferación y migración e invasión celulares, así como también ensayos de reposicionamiento de fármacos involucrados en mecanismos de regulación del balance energético.

Más recientemente, el laboratorio se ha focalizado en explotar herramientas de ciencias de datos para el análisis y procesamiento de base de datos provenientes de ámbitos clínicos. El objetivo de este proceso es generar nuevas hipótesis de trabajo que apunten al desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas que mejoren el manejo clínico de pacientes con distintas condiciones clínicas.

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN

Algunos de los proyectos en desarrollo actualmente son:

  • Estudio del rol de la cascada de ubiquitinación en el control del proceso de invasión tumoral y metástasis.
  • Estudio de la Inhibición de la vía autofágica como estrategia terapéutica en el tratamiento del cáncer.
  • Caracterización de mecanismos y funciones de las vías metabólicas degradativas celulares: su rol en el control de la división celular.
  • Ciencia de Datos aplicada al análisis e interpretación de datos biomédicos

PUBLICACIONES

  • Fabiana Alejandra Rossi & Mario Rossi, Emerging Role of Ubiquitin-Specific Protease 19 in Oncogenesis and Cancer Development, en la revista Frontiers in Cell and Developmental Biology (2022). https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35646888/
  • Jofré DM, Hoffman DK, Cervino AS, Hahn GM, Grundy M, Yun S, Amrit FRG, Stolz DB, Godoy LF, Salvatore E, Rossi FA, Ghazi A, Cirio MC, Yanowitz JL, Hochbaum D. The CHARGE syndrome ortholog CHD-7 regulates TGF-β pathways in in Caenorhabditis elegans, en Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) (2022). https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35394881/
  • Fabiana Alejandra Rossi, Ezequiel Hernán Calvo Roitberg, Juliana Haydeé Enriqué Steinberg, Molishree Umesh Joshi, Joaquín Maximiliano Espinosa & Mario RossiHERC1 Regulates Breast Cancer Cells Migration and Invasion (2021). Cancershttps://www.mdpi.com/2072-6694/13/6/1309
  • Fabiana Alejandra Rossi, Juliana Haydeé Enriqué Steinberg, Ezequiel Hernán Calvo Roitberg, Molishree Umesh Joshi, Ahwan Pandey, Martin Carlos Abba, Beatrice Dufrusine, Simonetta Buglioni, Vincenzo De Laurenzi, Gianluca Sala, Rossano Lattanzio, Joaquín Maximiliano Espinosa & Mario RossiUSP19 modulates cancer cell migration and invasion and acts as a novel prognostic marker in patients with early breast cancer. (2021). Oncogenesis. https://rdcu.be/cgG1H
  • Llorens MC, Rossi FA, García IA, Cooke M, Abba MC, Lopez-Haber C, Barrio-Real L, Vaglienti MV, Rossi M, Bocco JL, Kazanietz MG, Soria G. PKCα Modulates Epithelial-to-Mesenchymal Transition and Invasiveness of Breast Cancer Cells Through ZEB1. (2019). Front. Oncol. 27 November | https://doi.org/10.3389/fonc.2019.01323
  • Jeong YT, Simoneschi D, Keegan S, Melville D, Adler N, Saraf A, Florens L, Washburn MP, Cavasotto CN, Fenyö D, Cuervo AM, Rossi M*, Pagano M*.The ULK1-FBXW5-SEC23B nexus controls autophagy. (2018). Elife. Dec 31;7. pii: e42253.
  • Ferreyra Solari N, Belforte FS, Canedo L, Videla-Richarson G, Espinosa JM, Rossi M, Serna E, Riudavets MA, Martinetto H, Sevlever G, Perez-Castro C. The NSL complex subunit KANSL2 regulates cell stemness and tumorigenesis in glioblastoma. (2016). Cancer Research  pii: canres.3159.2015
  • Byk L, Iglesias N, De Maio F, Gebhard LG, Rossi M, Gamarnik A. Dengue Virus Genome Uncoating Requires Ubiquitination. (2016). mBio 7(3). pii: e00804-16.
  • Fiszbein A, Giono LE, Quaglino A, Berardino BG, Singaut L, von Bilderling C, Schor IE, Enriqué Steinberg J, Rossi M, Pietrasanta LI, Caramelo JJ, Srebrow A, Kornblihtt AR. A positive alternative splicing loop in G9a regulates neuron differentiation. (2016). Cell Reports 14, 2797-808
  • Rossi M, Rotblat B, Ansell K, Amelio I, Caraglia M, Misso G, Bernassola F, Cavasotto CN, Knight RA, Ciechanover A, Melino G. High throughput screening for inhibitors of the HECT ubiquitin E3 ligase ITCH identifies antidepressant drugs as regulators of autophagy. (2014).  Cell Death Dis May 1;5:e120
  • Abbas A, Mueller A, Shibata E, Keaton M, Rossi M, Dutta A. CRL1-FBXO11 promotes Cdt2 ubiquitylation and degradation and regulates Pr-Set7/Set8-mediated cellular migration. (2013). Mol Cell 49, 1147-58
  • Rossi M*, Duan S, Jeong YT, Horn M, Saraf A, Florens L, Washburn MP, Antebi A, Pagano M*. Regulation of the CRL4Cdt2 ubiquitin ligase by the SCFFbxo11 ubiquitin ligase. (2013). Mol Cell 49(6):1159-66.

INTEGRANTES

Dr. Mario Rossi – Director – mrossi-conicet@austral.edu.ar 

Dra. Fabiana A. Rossi – Becaria Postdoctoral – frossi-conicet@austral.edu.ar

Dra. Juliana H. Enriqué Steinberg – Becaria Postdoctoral – jenrique-conicet@austral.edu.ar

Dr. Ezequiel H. Calvo Roitberg – Estudiante recibido – ecalvo-conicet@austral.edu.ar

SUBSIDIOS

  • PICT-2018 | Estudio y caracterización del gen USP19 en el control del proceso de migración e invasión tumoral
  • PICT-2016 | Estudio del rol de la cascada de ubiquitinación en el control del proceso de
  • invasión tumoral y metástasis
  • PICT-2014 | Estudio de la Inhibición de la vía autofágica como estrategia terapéutica en el tratamiento del cáncer
  • PIDRI-PRH-2011 | Identificación y caracterización de genes del Sistema Ubiquitina-Proteosoma involucrados en el control del proceso de migración e invasión celular
  • PICT-2011 | Caracterización de mecanismos y funciones del Sistema Ubiquitina Proteosoma en el control de la replicación del ADN
  • R03 NIH – Fogarty, EE.UU | Role of the SCF/FBX011 ubiquitin ligase in the control of cell proliferation

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