Bienvenidas/os al Grupo de Investigación en Microbiota y Microbioma aplicado a la clínica, el cual llevamos adelante principalmente desde nuestro laboratorio llamado Biolab.
La misión de nuestro equipo de investigación es estudiar y analizar la microbiota y microbioma humano enfocándonos en posibles aplicaciones hacia la clínica, trabajando con técnicas y metodologías de vanguardia a nivel mundial en colaboración con instituciones de primer nivel, como el NIST (National Institute for Standards and Technology) de Estados Unidos y empresas como Illumina, Inc y Zymo Research.
Estamos fuertemente interesados en caracterizar y lograr una profunda comprensión de la relación entre microbiota, microbioma y diferentes condiciones en procesos de salud y enfermedad.
Realizamos análisis integrales de la microbiota y microbioma humano en un contexto interrelacionado de intervenciones clínicas, metabólicas, antropométricas y dietéticas para estudiar la relación entre todas estas características clave y llegar así a achicar la brecha entre la ciencia y posibles enfoques de diagnóstico y tratamiento de enfermedades.
En particular, desde el punto de vista del microbioma, partimos de una caracterización de su composición, para ir más allá en la identificación y estudio de posibles metabolitos activos y vías metabólicas relacionados con acciones directas en nuestro metabolismo.
Desde el punto de vista metodológico y científico nos enfocamos en estudiar todas las instancias y procesos involucrados en nuestro objetivo: desde la extracción de las muestras hasta la interpretación de los resultados, haciendo todos y cada uno de los pasos persiguiendo estándares internacionales.
Somos un laboratorio de investigación, docencia y transferencia tecnológica enmarcado en un ecosistema científico y empresarial situado en el Campus de la Universidad Austral, en Pilar (Argentina). El Hospital Universitario Austral, la empresa Sirius Software, La Facultad de Ciencias Biomédicas, el Instituto de Investigación en Medicina Traslacional (IIMT), la Facultad de Ingeniería y el Parque Empresarial Austral son componentes claves de un ecosistema que nos enriquece y potencia.
Actualmente contamos con una alianza estratégica con la empresa Sirius Software, quien nos ha equipado con diversos equipos para el procesamiento de muestras para análisis genómicos. En conjunto, buscamos dar respuesta a necesidades de índole biomédica en diversas áreas de aplicación.
jbustamante@austral.edu.ar – bustamante.bio@gmail.com
rodrigo.peralta93@gmail.com
rtaussig@austral.edu.ar
arcagnij@gmail.com
camilacontestabile@gmail.com
plopezvinas@gmail.com
Este estudio está enfocado en identificar fortalezas y limitaciones de las herramientas bioinformáticas que procesan los datos genómicos crudos, brindan información sobre alfa y beta diversidad, análisis diferencial y correlaciones. Para esto, estamos trabajando sobre conjuntos de datos públicos de artículos publicados, simulaciones de conjuntos de datos y procesamiento de los datos provenientes de nuestros propios proyectos de investigación.
En base a trabajos ya publicados a nivel mundial en el área; estamos armando una base de datos y análisis relacionados que describan relaciones entre, principalmente, microorganismos presentes en la microbiota y rutas metabólicas activas tanto de los mismos microorganismos como del organismo hospedador. Pues a medida que avanza el tiempo son más las repercusiones detalladas de metabolitos microbianos en las vías de señalización de los hospedadores.
En colaboración con el laboratorio de gastroenterología del Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo (INIGEM) del Hospital de Clínicas. En este estudio buscamos mejorar la calidad de vida de personas con obesidad, obesidad y prediabetes y obesidad y diabetes tipo 2 bajo un acompañamiento de 2 años con intervención de medicina de estilo de vida y alimentación basada en plantas. A su vez, buscamos estudiar una posible transición de estadíos de personas con obesidad/prediabetes/diabetes tipo 2 que remitan hacia controles o que evolucionen hacia perfiles similares a diabetes tipo 2 de acuerdo a parámetros clínicos y acompañados por perfiles de microbiota y microbioma. Tenemos registrado este ensayo clínico en ClinicalTrials.gov bajo el código NCT05372445.
Preprints
2023
Ignacio Cassol, Mauro Ibañez, Juan Pablo Bustamante
https://www.researchsquare.com/article/rs-2595260/v1
2023
Samuel P. Forry, Stephanie L. Servetas, Jason G. Kralj, Keng Soh, Michalis Hadjithomas, Martha Carlin, Maria G de Amorim, Benjamin Auch, Matthew G Bakker, Thais F Bartelli, Juan P. Bustamante, Ignacio Cassol, Mauricio Chalita, Emmanuel Dias-Neto, Daryl M. Gohl, Jekaterina Kazantseva, Muyideen T. Haruna, Peter Menzel, Bruno S Moda, Lorieza Neuberger-Castillo, Diana N Nunes, Isha R. Patel, Rodrigo D. Peralta, Adrien Saliou, Rolf Schwarzer, Samantha Sevilla, Isabella K T M Takenaka, Jeremy R. Wang, Rob Knight, Dirk Gevers, Scott A. Jackson
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.28.538741v2
Cassol, R.D. Peralta, R. Taussig, J.P. Bustamante
https://semipyp.es/pdf/anales/vol2_num1.pdf
jbustamante@austral.edu.ar – icassol@austral.edu.ar Mariano Acosta 1611
